Au siège parisien du Ctifl sont regroupés les directions de l’ensemble des départements.

Les centres d’expérimentation du Ctifl sont situés au cœur des principaux bassins français de production de fruits et de légumes. Ils se mettent au service des entreprises de la filière fruits et légumes de leur région :

• Les centres opérationnels de Balandran (30) et de Saint-Rémy de Provence (13) constituent le pôle Ctifl « Rhône-Méditerranée » : régions Rhône-Alpes, Languedoc Roussillon et Provence-Alpes Côte d’Azur.
• Centre opérationnel de Lanxade (24) : région du grand Sud-Ouest.
• Centre opérationnel de Carquefou (44) : régions du grand Ouest et du Nord de la France.

L’antenne de Rungis est localisée sur le MIN, au cœur du plus important marché de gros international. L’antenne de Nancy est dédiée aux professionnels de la région Est.